Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd247P24161 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd247P24161 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd247P24161 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd247P24161 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd247P24161 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd247P24161 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd247P24161 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd247P24161 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd247P24161 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms