Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama1P19137 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama1P19137 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama1P19137 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama1P19137 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama1P19137 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama1P19137 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama1P19137 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama1P19137 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama1P19137 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama1P19137 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama1P19137 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama1P19137 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama1P19137 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama1P19137 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms