Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka1P18653 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka1P18653 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka1P18653 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka1P18653 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms