Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb1P17919 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb1P17919 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb1P17919 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms