Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spi1P17433 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spi1P17433 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spi1P17433 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spi1P17433 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spi1P17433 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Spi1P17433 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spi1P17433 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms