Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pou4f1P17208 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou4f1P17208 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f1P17208 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou4f1P17208 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms