Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb3P17125 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb3P17125 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tgfb3P17125 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms