Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kcna3P16390 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcna3P16390 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kcna3P16390 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kcna3P16390 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kcna3P16390 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcna3P16390 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcna3P16390 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms