Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnc1P15388 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnc1P15388 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnc1P15388 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnc1P15388 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms