Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tnni2P13412 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tnni2P13412 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tnni2P13412 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tnni2P13412 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tnni2P13412 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Tnni2P13412 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Tnni2P13412 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27,56■■■□□ 2
Tnni2P13412 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Tnni2P13412 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Tnni2P13412 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
Tnni2P13412 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Tnni2P13412 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Tnni2P13412 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Tnni2P13412 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Tnni2P13412 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tnni2P13412 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tnni2P13412 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tnni2P13412 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Tnni2P13412 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tnni2P13412 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Tnni2P13412 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Tnni2P13412 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Tnni2P13412 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Tnni2P13412 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Tnni2P13412 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,4 ms