Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn1P12960 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntn1P12960 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn1P12960 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms