Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcp1P11983 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcp1P11983 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcp1P11983 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcp1P11983 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcp1P11983 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms