Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolP11369 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolP11369 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolP11369 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolP11369 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolP11369 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolP11369 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolP11369 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolP11369 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PolP11369 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PolP11369 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PolP11369 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PolP11369 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PolP11369 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PolP11369 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PolP11369 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolP11369 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolP11369 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolP11369 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolP11369 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolP11369 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolP11369 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PolP11369 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PolP11369 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolP11369 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PolP11369 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PolP11369 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PolP11369 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PolP11369 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PolP11369 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolP11369 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolP11369 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolP11369 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolP11369 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PolP11369 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolP11369 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PolP11369 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PolP11369 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PolP11369 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PolP11369 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PolP11369 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PolP11369 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolP11369 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolP11369 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolP11369 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolP11369 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolP11369 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolP11369 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolP11369 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolP11369 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PolP11369 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PolP11369 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolP11369 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PolP11369 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolP11369 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolP11369 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolP11369 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolP11369 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolP11369 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolP11369 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PolP11369 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PolP11369 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolP11369 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolP11369 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolP11369 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolP11369 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolP11369 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolP11369 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolP11369 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolP11369 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolP11369 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolP11369 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolP11369 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolP11369 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolP11369 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PolP11369 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PolP11369 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PolP11369 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolP11369 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolP11369 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PolP11369 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PolP11369 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolP11369 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolP11369 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms