Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FlgP11088 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FlgP11088 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FlgP11088 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FlgP11088 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FlgP11088 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FlgP11088 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FlgP11088 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FlgP11088 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FlgP11088 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FlgP11088 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FlgP11088 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FlgP11088 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FlgP11088 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FlgP11088 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FlgP11088 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FlgP11088 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FlgP11088 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FlgP11088 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FlgP11088 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FlgP11088 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FlgP11088 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FlgP11088 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FlgP11088 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FlgP11088 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FlgP11088 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FlgP11088 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FlgP11088 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FlgP11088 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FlgP11088 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FlgP11088 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FlgP11088 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FlgP11088 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FlgP11088 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FlgP11088 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FlgP11088 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FlgP11088 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FlgP11088 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FlgP11088 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FlgP11088 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FlgP11088 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FlgP11088 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FlgP11088 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FlgP11088 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FlgP11088 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FlgP11088 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FlgP11088 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FlgP11088 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FlgP11088 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FlgP11088 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FlgP11088 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FlgP11088 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FlgP11088 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FlgP11088 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FlgP11088 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FlgP11088 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FlgP11088 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FlgP11088 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FlgP11088 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FlgP11088 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FlgP11088 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FlgP11088 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FlgP11088 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FlgP11088 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FlgP11088 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FlgP11088 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FlgP11088 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FlgP11088 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FlgP11088 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FlgP11088 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FlgP11088 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FlgP11088 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FlgP11088 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FlgP11088 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FlgP11088 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FlgP11088 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FlgP11088 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FlgP11088 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FlgP11088 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FlgP11088 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FlgP11088 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FlgP11088 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FlgP11088 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FlgP11088 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FlgP11088 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FlgP11088 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FlgP11088 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FlgP11088 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms