Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcl2P10889 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl2P10889 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl2P10889 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms