Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb4P10284 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb4P10284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb4P10284 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb4P10284 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb4P10284 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb4P10284 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb4P10284 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb4P10284 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb4P10284 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb4P10284 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb4P10284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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