Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Schip1P0DPB4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Schip1P0DPB4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Schip1P0DPB4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Schip1P0DPB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms