Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UbbP0CG49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UbbP0CG49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UbbP0CG49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UbbP0CG49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UbbP0CG49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms