Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprqP0C5E4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprqP0C5E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprqP0C5E4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprqP0C5E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms