Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa9P09631 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa9P09631 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa9P09631 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms