Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NefmP08553 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NefmP08553 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NefmP08553 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NefmP08553 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NefmP08553 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NefmP08553 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NefmP08553 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NefmP08553 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NefmP08553 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NefmP08553 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NefmP08553 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NefmP08553 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NefmP08553 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NefmP08553 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NefmP08553 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NefmP08553 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NefmP08553 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NefmP08553 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NefmP08553 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NefmP08553 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NefmP08553 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NefmP08553 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NefmP08553 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NefmP08553 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NefmP08553 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NefmP08553 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NefmP08553 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NefmP08553 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NefmP08553 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NefmP08553 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NefmP08553 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NefmP08553 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NefmP08553 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NefmP08553 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NefmP08553 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NefmP08553 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NefmP08553 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NefmP08553 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NefmP08553 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NefmP08553 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NefmP08553 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NefmP08553 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NefmP08553 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NefmP08553 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NefmP08553 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NefmP08553 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NefmP08553 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NefmP08553 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NefmP08553 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NefmP08553 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NefmP08553 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NefmP08553 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NefmP08553 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NefmP08553 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NefmP08553 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NefmP08553 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NefmP08553 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NefmP08553 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NefmP08553 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NefmP08553 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NefmP08553 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NefmP08553 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NefmP08553 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NefmP08553 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NefmP08553 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NefmP08553 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NefmP08553 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NefmP08553 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NefmP08553 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NefmP08553 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NefmP08553 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NefmP08553 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NefmP08553 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NefmP08553 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NefmP08553 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NefmP08553 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NefmP08553 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NefmP08553 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NefmP08553 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NefmP08553 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NefmP08553 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NefmP08553 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NefmP08553 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NefmP08553 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NefmP08553 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NefmP08553 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NefmP08553 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NefmP08553 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NefmP08553 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NefmP08553 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NefmP08553 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NefmP08553 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NefmP08553 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms