Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apoa4P06728 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apoa4P06728 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa4P06728 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoa4P06728 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms