Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Lamc1P02468 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Lamc1P02468 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Lamc1P02468 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Lamc1P02468 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Lamc1P02468 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Lamc1P02468 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Lamc1P02468 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Lamc1P02468 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Lamc1P02468 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Lamc1P02468 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Lamc1P02468 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33,95■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Lamc1P02468 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Lamc1P02468 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,5 ms