Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
H2-Ab1P01921 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Ab1P01921 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Ab1P01921 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Ab1P01921 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms