Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01896 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01896 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01896 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01896 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01896 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01896 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01896 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01896 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01896 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01896 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01896 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01896 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01896 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01896 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01896 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01896 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01896 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01896 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01896 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01896 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01896 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01896 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01896 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01896 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01896 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01896 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01896 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01896 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01896 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01896 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01896 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01896 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01896 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01896 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01896 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01896 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01896 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01896 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01896 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01896 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01896 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01896 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01896 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01896 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01896 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01896 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01896 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01896 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01896 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01896 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms