Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01878 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01878 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01878 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01878 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01878 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01878 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01878 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
P01878 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01878 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01878 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01878 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01878 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01878 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01878 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
P01878 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01878 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01878 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01878 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01878 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01878 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01878 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01878 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01878 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01878 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01878 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01878 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01878 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01878 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01878 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P01878 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01878 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
P01878 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01878 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01878 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01878 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P01878 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01878 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01878 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01878 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01878 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01878 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01878 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01878 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01878 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01878 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01878 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01878 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01878 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P01878 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P01878 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01878 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01878 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01878 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01878 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01878 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01878 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01878 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01878 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01878 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01878 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01878 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01878 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01878 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01878 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01878 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01878 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P01878 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms