Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01843 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01843 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01843 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01843 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01843 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01843 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01843 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01843 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01843 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01843 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01843 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01843 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01843 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01843 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01843 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01843 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01843 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01843 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01843 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01843 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01843 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01843 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01843 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01843 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01843 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01843 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01843 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01843 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01843 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01843 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01843 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01843 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01843 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01843 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01843 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01843 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01843 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms