Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01837 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01837 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01837 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01837 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01837 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01837 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01837 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01837 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01837 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01837 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01837 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01837 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01837 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01837 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01837 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01837 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01837 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01837 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01837 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01837 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01837 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01837 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01837 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01837 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01837 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01837 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01837 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01837 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01837 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01837 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01837 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01837 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01837 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01837 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01837 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01837 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01837 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01837 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01837 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01837 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01837 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P01837 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01837 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01837 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01837 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01837 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01837 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms