Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01755 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01755 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01755 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01755 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01755 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01755 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01755 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.3 ms