Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01727 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01727 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01727 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01727 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01727 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01727 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01727 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01727 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01727 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01727 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01727 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01727 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01727 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01727 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01727 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01727 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01727 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01727 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01727 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01727 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01727 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01727 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01727 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01727 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01727 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01727 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01727 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01727 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01727 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01727 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01727 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01727 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01727 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01727 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01727 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01727 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01727 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01727 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01727 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01727 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01727 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01727 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01727 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01727 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01727 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01727 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01727 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01727 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01727 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01727 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms