Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna2P01573 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna2P01573 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna2P01573 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms