Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vti1aO89116 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vti1aO89116 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vti1aO89116 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vti1aO89116 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms