Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp8O89110 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp8O89110 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp8O89110 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp8O89110 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp8O89110 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp8O89110 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp8O89110 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp8O89110 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp8O89110 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp8O89110 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp8O89110 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp8O89110 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms