Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F11rO88792 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F11rO88792 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F11rO88792 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F11rO88792 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F11rO88792 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
F11rO88792 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F11rO88792 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F11rO88792 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F11rO88792 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F11rO88792 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F11rO88792 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F11rO88792 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F11rO88792 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
F11rO88792 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F11rO88792 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F11rO88792 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F11rO88792 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F11rO88792 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F11rO88792 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F11rO88792 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F11rO88792 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F11rO88792 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F11rO88792 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F11rO88792 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F11rO88792 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F11rO88792 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F11rO88792 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F11rO88792 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F11rO88792 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F11rO88792 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F11rO88792 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F11rO88792 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F11rO88792 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F11rO88792 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F11rO88792 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F11rO88792 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F11rO88792 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
F11rO88792 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F11rO88792 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F11rO88792 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F11rO88792 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F11rO88792 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F11rO88792 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F11rO88792 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F11rO88792 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F11rO88792 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F11rO88792 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F11rO88792 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F11rO88792 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F11rO88792 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F11rO88792 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F11rO88792 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms