Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hcn3O88705 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn3O88705 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn3O88705 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcn3O88705 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcn3O88705 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms