Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RradO88667 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RradO88667 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RradO88667 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RradO88667 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RradO88667 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RradO88667 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RradO88667 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RradO88667 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RradO88667 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RradO88667 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RradO88667 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RradO88667 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RradO88667 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RradO88667 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RradO88667 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RradO88667 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RradO88667 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RradO88667 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RradO88667 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RradO88667 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RradO88667 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RradO88667 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RradO88667 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RradO88667 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RradO88667 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RradO88667 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RradO88667 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RradO88667 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RradO88667 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RradO88667 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RradO88667 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RradO88667 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RradO88667 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RradO88667 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RradO88667 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RradO88667 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RradO88667 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RradO88667 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RradO88667 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RradO88667 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RradO88667 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RradO88667 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RradO88667 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RradO88667 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RradO88667 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RradO88667 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RradO88667 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RradO88667 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RradO88667 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RradO88667 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RradO88667 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RradO88667 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RradO88667 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RradO88667 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RradO88667 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RradO88667 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RradO88667 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms