Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly86O88188 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly86O88188 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly86O88188 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly86O88188 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly86O88188 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly86O88188 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly86O88188 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly86O88188 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly86O88188 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly86O88188 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly86O88188 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms