Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx12O70493 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx12O70493 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx12O70493 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx12O70493 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx12O70493 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx12O70493 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx12O70493 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx12O70493 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx12O70493 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx12O70493 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx12O70493 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx12O70493 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms