Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna4O70174 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna4O70174 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna4O70174 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna4O70174 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna4O70174 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms