Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mmp8O70138 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mmp8O70138 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mmp8O70138 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mmp8O70138 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mmp8O70138 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp8O70138 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms