Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChadO55226 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChadO55226 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChadO55226 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChadO55226 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChadO55226 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChadO55226 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChadO55226 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChadO55226 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChadO55226 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChadO55226 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChadO55226 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChadO55226 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChadO55226 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChadO55226 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChadO55226 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChadO55226 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChadO55226 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChadO55226 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChadO55226 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChadO55226 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChadO55226 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChadO55226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChadO55226 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChadO55226 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChadO55226 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChadO55226 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChadO55226 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChadO55226 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChadO55226 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChadO55226 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChadO55226 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChadO55226 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChadO55226 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChadO55226 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChadO55226 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChadO55226 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChadO55226 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChadO55226 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChadO55226 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChadO55226 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChadO55226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChadO55226 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ChadO55226 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChadO55226 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChadO55226 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChadO55226 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChadO55226 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChadO55226 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChadO55226 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChadO55226 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChadO55226 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChadO55226 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChadO55226 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChadO55226 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChadO55226 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ChadO55226 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChadO55226 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChadO55226 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ChadO55226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChadO55226 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChadO55226 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChadO55226 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChadO55226 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ChadO55226 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChadO55226 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChadO55226 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChadO55226 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ChadO55226 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ChadO55226 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChadO55226 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChadO55226 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChadO55226 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms