Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acot1O55137 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acot1O55137 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acot1O55137 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acot1O55137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Acot1O55137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acot1O55137 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acot1O55137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acot1O55137 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acot1O55137 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acot1O55137 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acot1O55137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acot1O55137 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acot1O55137 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Acot1O55137 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acot1O55137 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acot1O55137 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acot1O55137 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acot1O55137 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms