Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg2O55111 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg2O55111 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg2O55111 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg2O55111 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms