Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3O54890 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3O54890 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb3O54890 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb3O54890 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb3O54890 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms