Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp100O35892 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp100O35892 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp100O35892 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp100O35892 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp100O35892 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp100O35892 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp100O35892 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp100O35892 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp100O35892 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp100O35892 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp100O35892 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp100O35892 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp100O35892 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp100O35892 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp100O35892 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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