Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Timm44O35857 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Timm44O35857 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Timm44O35857 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Timm44O35857 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Timm44O35857 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Timm44O35857 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Timm44O35857 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Timm44O35857 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Timm44O35857 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Timm44O35857 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms