Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccrl2O35457 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccrl2O35457 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccrl2O35457 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccrl2O35457 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccrl2O35457 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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