Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld3O35405 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld3O35405 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pld3O35405 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pld3O35405 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pld3O35405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pld3O35405 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld3O35405 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pld3O35405 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pld3O35405 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld3O35405 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld3O35405 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pld3O35405 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pld3O35405 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld3O35405 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld3O35405 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld3O35405 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld3O35405 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld3O35405 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms