Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppef2O35385 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppef2O35385 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppef2O35385 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppef2O35385 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppef2O35385 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppef2O35385 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms