Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf2O35218 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf2O35218 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpsf2O35218 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf2O35218 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms